題目：大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的小麥-白粉菌相互作用機(jī)制解析初探

主講：賀飛 研究員

時(shí)間：4月12日 14:30

地點(diǎn)：學(xué)實(shí)樓601

主講人簡介:

賀飛，中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所研究員，中科院-英國約翰·英納斯中心（JIC）植物和微生物聯(lián)合研究中心（CEPAMS）課題組組長。本科畢業(yè)于西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院，2011年在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院獲得生物信息學(xué)博士學(xué)位，先后在美國斯隆凱特琳癌癥中心、布魯克海文國家實(shí)驗(yàn)室、堪薩斯州立大學(xué)從事博士后研究。長期從事生物信息學(xué)與農(nóng)作物基因組學(xué)研究。

由專性活體寄生的白粉菌 (Bgt, Blumeria graminins f. sp. tritici）引起的白粉病，嚴(yán)重威脅著中國的小麥生產(chǎn)。發(fā)掘小麥中的白粉病抗性基因（R基因）和Bgt中相應(yīng)的無毒基因（Avr基因），以及了解它們之間相互作用的分子機(jī)制，有助于開發(fā)新的白粉病防治手段。到目前為止，已克隆的R基因和Avr基因數(shù)量有限，阻礙了我們對它們之間分子識(shí)別機(jī)制的理解。賀飛博士搭建了小麥-白粉菌相互作用表型篩查平臺(tái)，完成了對100多份小麥白粉菌小種的基因組測序工作，已進(jìn)行500份小麥與100份白粉小種的相互作用表型鑒定工作，通過雙向全基因組關(guān)聯(lián)研究（biGWAS）快速挖掘R-Avr互作。結(jié)合現(xiàn)有的基因型數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)，進(jìn)行了跨物種的GWAS初步分析，結(jié)果表明該策略可以鑒定出已知和未知的R/Avr基因。