近日，信息科學與工程學院孫曉勇教授團隊在《Nucleic Acids Research》database issue在線發表了題為“PlantCircRNA: A comprehensive database for plant circular RNAs” 的研究論文。信息科學與工程學院在讀碩士研究生和樹天與本科生邴建皓為本文并列第一作者，孫曉勇教授為本文通訊作者。

環形RNA(circ RNAs)是一種特殊類型的非編碼RNA，CircRNAs是由3′端下游供體和5′端上游受體經反向剪接形成的閉合環狀分子，普遍存在于真核生物中。circRNAs結構穩定，具有重要的非編碼功能，在調節基因表達和各種生物學功能方面起著重要作用。circRNAs在植物體內也起著重要的調控作用，影響植物的根、莖、葉、花、果實以及其他器官生長發育。為了幫助學術界研究植物環形RNA，該團隊對94種植物進行了系統的分析挖掘，構建了一個目前世界最大的植物環形RNA數據庫：PlantCircRNA (https://plant.deepbiology.cn/PlantCircRNA/)。

PlantCircRNA是一個涵蓋94種植物的大數據平臺。這一新資源不僅對39,245 RNA-seq 樣品進行了分析挖掘，提取相關環形RNA數據，還將前期課題組構建的AtCircDB和CropCircDB進行了整合。針對組織特異性和各類脅迫，平臺都進行了系統的標注和梳理。另外依據81篇文獻，平臺對學術界已經發現的環形RNA進行了進一步標注，并提出了detection score算法支持數據的可靠性。該研究為學術界提供一個最為全面的植物環形RNA大數據平臺，對研究植物環形RNA具有重要的應用價值。

該研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助，學校超級計算中心提供了算力支持。

論文鏈接：https://doi.org/10.1093/nar/gkae709

編      輯：萬    千 

審      核：賈    波