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植物保護學院原雪峰團隊在小麥黃花葉病毒蛋白翻譯調控研究中取得新進展

作者:原雪峰記者:通訊員:攝影: 出處:發布時間:2023-11-23

近日,植保學院原雪峰團隊在小麥黃花葉病毒(WYMV)蛋白翻譯調控研究方面取得新進展,以“Variable eIF4E-binding sites and their synergistic effect on cap independent translation in a novel IRES of wheat yellow mosaic virus RNA2 isolates”在《International Journal of Biological Macromolecules》在線發表,揭示了WYMV不同分離物RNA2中的核糖體內部進入位點(IRES)的活性差異原因,關鍵在于局部RNA結構差異及其與翻譯起始因子eIF4E互作差異。第一作者是已畢業博士生耿國偉(現就職于魯東大學),通訊作者為原雪峰教授。

通過體外翻譯、RNA結構分析、突變分析、RNA與蛋白互作分析等,發現WYMV的HC分離物與LYJN分離物的RNA2均含有不依賴帽子翻譯元件IRES,但其活性相差7倍。IRES元件主要包含2個莖環H1和H2,在2個分離物的H1中均含有一個翻譯起始因子eIF4E結合位點,而LYJN分離物H2中還含有另一個eIF4E結合位點。在HC分離物與LYJN分離物的RNA2中含有不同數量的eIF4E結合位點,并且LYJN分離物RNA2中的2個eIF4E結合位點還存在協同效應,此協同效應由莖環H1的底部柔性莖來實現,使得位于莖環H1和H2中的eIF4E結合位點可以在物理位置上靠近(圖1)。

圖1 WYMV RNA2中IRES元件結構及其與eIF4E的互作特征


該研究首次發現了在同種病毒不同分離物IRES元件中存在不同數量的eIF4E結合位點,且位點之間存在協同結合eIF4E的效應。此研究成果是該團隊在WYMV RNA1發現IRES元件的三級動態平衡RNA結構(2020, Nucleic Acids Research)之后在不依賴帽子翻譯調控方面的又一新進展。綜合2個研究成果發現,WYMV基因組RNA1和RNA2中IRES元件的進化方向不同,RNA1中IRES結構保守,而RNA2中IRES變動活躍,可能與各自編碼的病毒蛋白功能有關。

原雪峰團隊長期專注于植物RNA病毒翻譯調控尤其是不依賴帽子翻譯調控研究,針對多種植物RNA病毒的不依賴帽子翻譯調控元件進行RNA結構解析和核心特征注釋,發表多篇研究文章,并撰寫植物RNA病毒翻譯調控的綜述,主持成果“植物RNA病毒的不依賴帽子翻譯調控”獲得第十屆淮海科學技術獎二等獎(2023)。

文章鏈接:https://authors.elsevier.com/a/1i5rCWFfgtGUJ


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