題目：小麥基因組的戰(zhàn)爭與和平——轉(zhuǎn)座子與小麥進化

主講：張一婧 研究員

時間：6月21日9:00

地點：國重樓一樓報告廳

主講人簡介:

張一婧，復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究員。2013-2021年在中科院上海植物生理生態(tài)研究所任研究員及課題組長；2021年加入復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院。近年來通過全基因組解析小麥轉(zhuǎn)座子與相關(guān)表觀因子的調(diào)控功能，從多層面揭示轉(zhuǎn)座子擴張介導(dǎo)多倍體可塑性與功能基因組演化的分子機制。結(jié)合高通量實驗，大數(shù)據(jù)分析和遺傳學(xué)篩選等多學(xué)科手段，從技術(shù)開發(fā)到科學(xué)問題探索取得了一系列進展。近五年來作為通訊作者，在Genome Research，Nature Communications, Genome Biology (2), Plant Cell和Nucleic Acids Research 等期刊發(fā)表方法學(xué)文章及研究論文。

普通小麥起源于約1萬年前的六倍化事件，伴隨農(nóng)業(yè)革命，從中亞新月沃地傳播到世界各地，成為全球種植面積最廣泛的谷類作物。普通小麥具有高度的環(huán)境可塑性，一般認為可能由于融合了適應(yīng)不同環(huán)境的三套二倍體基因組。小麥在進化過程中經(jīng)歷了多次轉(zhuǎn)座子爆發(fā)事件，具有龐大的基因組和豐富的轉(zhuǎn)座子。三套基因組的基因間區(qū)積累了大量譜系特異性轉(zhuǎn)座子，高度分化的間區(qū)序列如何調(diào)控亞基因組表達的分化與協(xié)同？不同時期擴張的轉(zhuǎn)座子如何介導(dǎo)調(diào)控的演化，并進一步影響農(nóng)藝性狀？我們通過結(jié)合染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)，表觀組，轉(zhuǎn)錄組及基因組信息，揭示了小麥轉(zhuǎn)座子從多個層面貢獻于小麥基因組調(diào)控的演化，推測并驗證轉(zhuǎn)座子對發(fā)育性狀的影響，闡明轉(zhuǎn)座子池的可塑性特異性影響多倍體調(diào)控的可塑性。